Os programas de qualidade e as atividades de cunho ambiental do Fleury seguem as diretrizes estabelecidas na Política de Sustentabilidade da empresa.
Certificado em 1999 pela norma ISO 9001, em 2002 pela norma ISO 14001 e em 2010 pelo PALC, o Fleury ainda participa ativamente de rigorosos programas de controle de qualidade de nível nacional e mundial, entre os quais se destacam o Surveys and Anatomic Pathology Education Programs, do College of American Pathologists (CAP) e a Proficiência em Ensaios Laboratoriais, da Sociedade Brasileira de Patologia Clínica/Medicina Laboratorial (SBPC/ML). Isso permitiu que em 2007 o Fleury obtivesse a acreditação do CAP.